故事讲述了一个跨越千年的翼人传说。　　　一位懂“法术”的、以表演人偶为生的青年国崎往人，一天来到一个海边小镇，遇上了主角的神尾观铃而展开的故事。国崎往人和他的祖先们一直都在找一位在天空中有翼的女孩子，而在和观铃一路相处之下，观铃可能就是他要寻找的女孩子。　在古日本有位背上长上一对翅膀的女孩子（称为翼人）神奈备命，给人视为不详的象征所以被人软禁着。后来遇上了被派来“保护”她的柳也，和女官里叶一起去寻找母亲（八百比丘尼）。可惜最后母女两人也被人杀死，神奈是在空中给人乱箭射死。可是死后她没有掉下来，而是在空中飘浮着，并且受到诅咒，堕入无限的轮回。里叶和柳也为了帮助神奈，决定为了神奈，要诞下后代来替自己完成心愿。1000年后也就变成了翼人传说。　而观铃就是继承了翼人的女孩，往人（和其祖先）则是柳也他们的后代，而原作中出现的佳乃和美凪则是和从翼人的翼掉下来的羽毛所影响的人物。　故事的重心是“家族爱”（亲情）。